Sequências reguladoras importantes para
replicação viral localizadas em cada terminação do
genoma do HIV. A LTR (long terminal repeat) inclui o
AMPLIADOR HIV, o promotor e outras sequências. As regiões específicas na LTR incluem o elemento regulador negativo (NRE: negative regulatory element),
sítios de ligação NF-kappa B e Sp1,
TATA BOX e elemento responsivo transatuante (TAR: trans-acting responsive element). A ligação das
proteínas celular e viral a estas regiões regula a transcrição do HIV.